干细胞另一个重要的特征是95%以上的细胞在体内处于静止期(phase G0),不进行DNA合成和有丝分裂。静止的造血干细胞具有对4-HT或5-FU的抗性。Rh123也不染或淡染。这些特征以及表型CD34和CD133等均可用于造血干/祖细胞的分选。

干细胞不断地在G0静止期与G1期之间来回转换,在体内又始终保持95%以上在G0期。干细胞的静止状态有利于有丝分裂中发生轻微点突变的基因DNA的修复,避免发展为不可逆的多基因突变,而引起干细胞的恶性变。

当机体发生缺氧、感染、失血和创伤等应激状态时,干细胞从静止转增殖周期的数量增加,以满足机体对造血的需求。但此时干细胞的有丝分裂仍然是不对称的,以保持自我更新和自我维持的特征。在应激状态下,体内造血细胞的扩增仍然靠祖细胞。

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