参照《性传播疾病临床诊疗指南（2007）》（中国疾病预防控制中心性病控制中心）。
一期梅毒
硬下疳：需与软下疳、生殖器疱疹、性病性淋巴肉芽肿、糜烂性龟头炎、贝赫切特（Behçet）综合征白塞病、固定型药疹、癌肿、皮肤结核等发生在外阴部的红斑、糜烂和溃疡鉴别。
梅毒性腹股沟淋巴结肿大：需与软下疳、性病性淋巴肉芽肿引起的腹股沟淋巴结肿大，以及转移癌肿鉴别。
二期梅毒
梅毒性斑疹：需与玫瑰糠疹、银屑病、扁平苔藓、手足癣、白癜风、花斑癣、药疹、多形红斑、远心性环状红斑等鉴别。
梅毒性丘疹和扁平湿疣 ：需与银屑病、体癣、扁平苔藓、毛发红糠疹、尖锐湿疣等鉴别。
梅毒性脓疱疹：需与各种脓疱病、脓疱疮、臁疮、雅司等鉴别。
黏膜梅毒疹：需与传染性单核细胞增多症、地图舌、鹅口疮、扁平苔藓、麻疹、化脓性扁桃体炎等鉴别。
梅毒性脱发：需与斑秃鉴别。
三期梅毒
结节性梅毒疹：需与寻常狼疮、结节病、瘤型麻风等鉴别。
树胶肿：需与寻常狼疮、瘤型麻风、硬红斑、结节性红斑、小腿溃疡、脂膜炎、癌肿等鉴别。
神经梅毒：梅毒性脑膜炎需与结核性脑膜炎、隐球菌性脑膜炎、钩端螺旋体病引起的脑膜炎等相鉴别。脑膜血管梅毒需与各种原因引起的脑卒中相鉴别。麻痹性痴呆需与脑肿瘤、动脉硬化、阿尔茨海默病（老年性痴呆）、慢性酒精中毒和癫痫发作等相鉴别。脊髓痨需与埃迪（Adie）综合征、糖尿病性假脊髓痨等鉴别。
心血管梅毒：梅毒性主动脉瘤需与主动脉硬化症相鉴别。梅毒性冠状动脉病需与冠状动脉粥样硬化相鉴别。梅毒性主动脉瓣闭锁不全需与感染性心内膜炎、先天性瓣膜畸形等引起的主动脉瓣闭锁不全相鉴别。
神经梅毒
梅毒性脑膜炎：需与结核性脑膜炎、隐球菌性脑膜炎、钩端螺旋体病引起的脑膜炎等相鉴别。
脑膜血管梅毒：需与各种原因引起的脑卒中相鉴别。
麻痹性痴呆：需 与脑肿瘤、动脉硬化、阿尔茨海默病（老年性痴呆）、慢性酒精中毒和癫痫发作等相鉴别。
脊髓痨：需与埃迪（Adie）综合征、糖尿病性假脊髓痨等鉴别。
