基因的转录是通过转录因子结合到靶基因的特异位点(转录因子结合位点)来完成的。在信息学分析中常常采用共有序列、序列标识图、位置频率矩阵和位置权重矩阵等来表示转录因子结合位点。基因转录调控的信息学分析包括三方面的研究内容:一是从众多序列中鉴定出同一转录因子的共有序列,称之为转录因子的识别。其次分别应用单个模体测算法、遗传系谱印记法、顺式调控模块识别法、SISSR算法等多种方法进行评估和分析,找出具有统计显著性的短片段。这些数据库各有所长,它们为转录因子结合位点的识别和定位研究提供了重要数据资源。 ......