本病应与其他病原所致的感染性腹泻、败血症、疟疾、阿米巴肝脓肿、急性阑尾炎和黄疸型肝炎等疾病进行鉴别。从临床诊断角度应该怀疑每一个腹泻伴随发热,且临床检验便常规白细胞阳性的患者。关节炎和结节性红斑的患者,如果同时存在腹部症状或不久前曾有发热和腹泻的患者,临床上就应该做出小肠结肠炎耶尔森菌感染的印象诊断。小肠结肠炎耶尔森菌感染血清学诊断还是较可靠的,因疾病的急性期和并发症期,血清抗体水平都比较高,可用双份患者血清做血清学反应,抗体滴度4倍升高可确诊。发生并发症的患者根据病症不同可发生不同的损害,如反应性关节炎 ......