小 结

同源序列一般是相似的，相似序列不一定是同源的。序列比较的基本操作是比对，两个序列的比对是指这两个序列中各个字符的一种一一对应关系，或字符的对比排列。矩阵作图法”可以直观地发现比对序列是否存在匹配序列。相似性得分是以某种固定的记分规则规定两两字符比较的分数，然后将序列所有字符的比较得分相加得到两条序列的相似性得分。常用的核酸序列记分规则包括：等价矩阵、转换-颠换矩阵、BLAST矩阵。动态规划算法普遍应用于生物信息学中的序列比对。 ......