焦虑和恐惧的主要神经输入为脑的外周感觉系统(听觉、视觉、身体感觉)。它们被有序地组织起来,直接或通过多突触路径传导与焦虑或恐惧有关的信息。能够引起恐惧和焦虑的刺激从外周感受器传导到背侧丘脑。因此许多引起恐惧和焦虑的信息首先被送到感觉皮层,然后再转入与感情、行为和身体反应有关皮层下结构。这些证据表明,杏仁核是对诱发恐惧和焦虑的感觉信息进行传递和整合的枢纽。从上述提到的“短弧”和“长弧”的角度来看,面对威胁,杏仁核直接通过短弧来刺激这一神经网络的反应输出部分,而长弧则向杏仁核提供整合的信息,对恐惧反应是否应该持续或停止进行调解。
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