二、基于化合物构效关系的药效团构建

在前面我们刚刚介绍了构建基于化合物共同特征药效团操作方法。在基于化合物共同特征的药效团中，所有训练集的分子不需要输入活性数据，在药效团的产生过程中被同等的看待，所得到的药效团模型可以用来检索化合物数据库以寻找骨架新颖的先导化合物，但不能预测新化合物的活性。如果想用得到的药效团模型来预测新化合物活性以及进行构效关系研究，这时就需要构建基于化合物构效关系的药效团模型。