[文献资料]二、Gen T HREADER法

现将其算法描述如下：1 ﹒将待预测序列与模板库中的蛋白质比对，得到比对的得分数，同时可获取如下参数：比对长度、模板蛋白长度、待预测序列长度，并根据如下两个公式计算原子配对能量Δ ab k和溶剂化能量Δ a solv（r）。F k（s）所有残基对中相距为k，距离为s的频率值。R是残基埋藏的程度。2 ﹒以比对得分数，待预测序列长度、模板蛋白质长度、比对长度，原子配对能量和溶剂化能量作为输入层，以待预测蛋白和模板蛋白是否相关为输出层（相关为1，不相关.在一个翻译细菌基因组中，将它用于自动预测蛋白质结构，其假阳性率很低。