真菌感染可分为浅部和深部感染两类。深部感染常由白色念珠菌和新型隐球菌引起,主要侵犯内脏器官和深部组织,发病率虽低,但危害性大,常可危及生命。危重患儿由于抵抗力低及广谱强效抗生素的使用,常易合并真菌感染,发生于危重患儿的深部真菌感染主要为念珠菌及曲霉菌。随着抗真菌药的研发及新品种的出现,极大改善了系统性真菌感染的转归,但在免疫功能抑制的患者中,系统性真菌感染仍有较高的病死率。副作用为发热、药物疹、肝肾毒性、白细胞及血小板下降。