本品对各种革兰阳性菌包括球菌与杆菌均具有强大抗菌作用。耐甲氧西林金葡菌(MRSA)、耐甲氧西林表皮葡萄球菌(MRSE)和肠球菌属对本品非常敏感,几无耐药菌株,对大多数革兰阴性菌、拟杆菌属、分枝杆菌属、立克次体属、衣原体属或真菌均无效。本品口服不吸收,静脉给药后可广泛分布于全身大多数组织和体液内,在血清、胸膜、心包、腹膜、腹水和滑膜液中可达有效浓度,尿中浓度高,胆汁中不能达有效浓度,不能迅速穿过正常血‐脑脊液屏障进入脑脊液中,但脑膜发炎时可渗入脑脊液中并达有效治疗浓度。本品可通过胎盘。血液透析或腹膜透析不能有效地清除本品。万古霉素与碱性溶液有配伍禁忌,遇重金属可发生沉淀。
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