BBB相关的特异基因及蛋白的鉴定是随着基因组和蛋白质组技术的发展而发展的。由于脑毛细血管内皮的含量占整个脑组织的比例极低,每克脑毛细血管内皮只有1 μ l,重1200g的人脑组织,毛细血管内皮细胞只有5ml,因此只有在BBB中表达丰度很高的基因才可能在全脑组织的基因谱中检测到(PardridgeWM,2003b。近年来,随着基因组学和蛋白质组学研究新技术和方法的兴起,脑毛细血管内皮RNA纯化技术的日臻成熟,很多研究者研究了脑微血管与其他器官血管的特异性基因组和蛋白质组,得出一些令人感兴趣的结果。
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