胶模应立于盘中以免液体流出。TEMED与储存液一起加,无过硫酸铵时它不能催化聚合。在加过硫酸铵前可能需要过滤单体溶液。一切就绪后才能加过硫酸铵,因为之后十分钟胶就开始聚合。TEMED和过硫酸铵的加入量依据作者的经验。为了得到带有直边的可重现胶,与指导手册相比,TEMED浓度较高,过硫酸铵浓度较低。而且,在碱性pH时,过硫酸铵能与Tris反应。此效应可通过多加TEMED,降低过硫酸铵浓度而降至最小。在夏天实验室无空调,或者在较热的国家可能需要把过硫酸铵的量减少10%~20%。在拆除时,用蒸馏水漂洗每块胶的上表层以去除丁醇(butanol),漂洗胶盒以去除多余的聚丙烯酰胺。加入过硫酸铵后立即铺胶。
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