包裹或吸附于载体材料上的质粒DNA的结构或功能是否保持完整需要评价,因为在制备过程中往往引入了有机溶剂或使用了超声的方法。功能的完整性可采用下面即将要提到的体外转染实验来进行,通过与未经任何处理的裸质粒DNA的比较,从而判断其功能的完整性。