用于在受体细胞中进行基因扩增的载体称为克隆载体(cloning vector)。克隆载体一般是具有较低分子量,较高拷贝数的松弛型复制子。DNA克隆技术中最常用的克隆载体有质粒,其次还有噬菌体λ、噬菌体M13和COS质粒(cosmid)。