分子生物学方法和技术如核酸探针技术(DNA探针、RNA探针)、各种PCR技术(复合PCR、套式PCR、固相PCR、PCR‐ELISA、PCR RFLP、逆转录PCR、SSR‐PCR等)及DNA阵列/芯片技术等在寄生虫的鉴定和寄生虫。尤其是在寄生虫种的鉴定方面发挥着特别重要作用,如溶组织内阿米巴和迪斯帕内阿米巴在形态上很难区分,但用PCR方法,甚至仅1对引物即可以将两者区别开来。从粪便样本提取DNA,进行PCR检测,已用于蓝氏贾第鞭毛虫、隐孢子虫、卡氏圆孢子虫、微孢子虫、溶组织内阿米巴/迪斯帕内阿米巴、口腔 ......