随着对多肽和蛋白质的构象单元卷曲机制及构效关系的深入研究,对已知结构蛋白质数据库的全面分析及构象预测理论的不断进步,人们已能够以特定的构象单元与功能的关系为指导,设计具有特定功能的多肽。利用已知的蛋白质结构原理,从设计结构的角度出发,获得新的多肽,使其具有与天然多肽相似或更特定的结构,并具有人类所要求的功能。在稳定的三级结构中,相邻的氨基酸残基的侧链非常靠近,应考虑氨基酸残基侧链在电荷、疏水及体积方面的匹配,如支链的残基不应相邻。二硫键的引入:二硫键的引入会增加多肽稳定性,但也可能破坏其他稳定多肽的作用力,因此需要借助已了解的三维结构或分子模型选择合适的二硫键位点。
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