三、四维和五维定量构效关系

经典的三维定量构效关系都为受体独立性3D‐QSAR，即进行QSAR分析时涉及的数据主要为配体结构和活性的数据，而与受体的结构和活性无关。相反的，如果在对受体结构和配体活性数据进行基于结构的分子设计时，生成的3D‐QSAR模型多与受体结构有关，我们则称此QSAR为受体依赖性3D‐QSAR。现在讨论的3D‐QSAR多为受体独立性3D‐QSAR。由于5D‐QSAR考虑的受体结构因素过多，其模型验证能力与4D‐QSAR比较未见优越性，但是，由于5D‐QSAR对受体环境的准确模拟，使其预测能力较3D‐QSAR、4D‐QSAR提高很多，这才是5D‐QSAR的优势所在。