该PBP2a由mec A基因编码,每一种MRSA菌株都有mec A基因,而敏感株则没有,mec R1及mec I是控制基因,可通过抑制mec A基因的转录,决定PBP2a的合成水平而控制细菌的耐药程度,在细菌基因组中还存在着辅助基因fem A、fem B、fem C及fem D,与甲氧西林耐药性表达有关。