Sanger法测序是弗雷德里克·桑格于1977年发展出来的全球第一种用于DNA测序的方法,该方法的开发使得桑格获得了1980年的诺贝尔化学奖,是人类基因组计划实施的基础。Sanger法测序主要基于桑格发明的双脱氧链终止法( chain termination method )和PCR反应。通常情况下待测模板会在DNA聚合酶的作用下不断延伸,但由于ddNTP的加入,该延伸可能随机在A 、 T 、 G或C处终止,从而产生以A 、 T 、 C 、 G结尾的四组不同长度的核苷酸。由于4种ddNTP被4种不同颜色的荧光标记,因此将延伸反应产物置于尿素变性的PAGE胶上电泳并进行荧光检测即可根据电泳时间和荧光信号的出现顺序获取DNA碱基序列。
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