文拉法辛主要代谢为具有药理活性的代谢产物O‐去甲基文拉法辛(ODV),另一种代谢产物为N‐去甲基文拉法辛。文拉法辛对CYP2D6有较轻的抑制作用,比帕罗西汀、氟西汀、氟伏沙明、舍曲林均弱。所以,该药对其他药物药动学的影响均较小。当文拉法辛150mg/d与丙米嗪或地昔帕明合用时,可使AUC增加27%和40%。另外,合用文拉法辛使氟哌啶醇的Cmax增加88%,但是氟哌啶醇的消除半衰期没有变化,目前仍不明这种变化的机制。CYP2D6酶对多种抗抑郁药的代谢活性决定于基因多态性。文拉法辛的代谢可能受到其他抑制CYP2D6酶的药物影响,如奎尼丁可能减缓文拉法辛代谢为ODV,使文拉法辛的血药浓度升高,ODV的浓度降低。
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