LDR是近年出现的突变检测技术[ 34 ],利用连接酶只能将严格配对的两个碱基连接起来的原理。另外再设计一段寡核苷酸探针,使其5 ’恰与突变位点相接,并在其上标记上荧光。阵列杂交后洗脱,未联结的标记探针易被洗脱,而经连接酶连结的则留在了阵列上,从而得以检出(图。Favis [ 36 ]等用LDR芯片成功地检测了导致犹太人BRCA1突变的185位AG缺失和5382位插入C,导致BRCA2突变的6174位T缺失,克服了以往直接杂交法经常出现假阴性的缺陷。