阿米卡星禁用于对阿米卡星或其他氨基糖苷类过敏的患者。慎用于失水、肾功能损害、第八对脑神经损害、重症肌无力或帕金森病、孕妇、哺乳期妇女、小儿及老年患者。因为阿米卡星可穿过胎盘到达胎儿体内,早产儿及新生儿的肾脏组织尚未发育完全,使阿米卡星消除半衰期延长,易在体内蓄积产生毒性反应,可能引起胎儿、新生儿或小儿听力损害和肾功能损害。虽然庆大霉素与碱性药如碳酸氢钠、氨茶碱等联合应用,可提高抗菌活性,但是,可能增加肾毒性和耳毒性的发生率,必须权衡利弊,慎重对待。