干扰核酸合成的药物分为直接干扰核酸合成和嵌入DNA中干扰核酸合成两大类。能与二氢叶酸相竞争,强烈且持久地抑制二氢叶酸还原酶的活性,阻断其功能,使叶酸不能转变为具有活性的四氢叶酸而发挥辅酶作用,从而阻止脱氧尿苷酸转变为脱氧胸苷酸的形成,以干扰核酸合成。代表药物是巯嘌呤或其衍生物,如硫唑嘌呤、磺巯嘌呤钠、苷氨硫嘌呤、硫鸟嘌呤、巯嘌呤、氯嘌呤、巯嘌呤苷、氮鸟嘌呤、去氧硫鸟苷、氯脱氧腺苷、阿佐霉素。人工合成的嵌入剂,这类药物有氨耐非特、安丫啶、玫瑰树碱、麦尔巴隆、米托蒽醌、吡咯蒽醌、阿克罗宁。