（二）合理药物设计的基本方法

间接设计（模拟）方法是在未知靶物质结构情况下，探索一系列底物或药物三维定量构效关系（3D QSAR），反推靶物质结构和性质，在此基础上再利用包括三维结构搜索（3D Structural Search）在内的方法设计新化合物。