现以下述例子说明应用QSAR设计药物的步骤。例如利用QSAR辅以其它手段研究吡喃息胺(Pyranenamide,31)类抗过敏性哮喘药物。大致分为四个步骤:第一步,采用Topliss合成树(Synthetic Tree)制备了19个衍生物,试图寻找活性较高的化合物,但未获突破,后对其中活性最大的4 OH化合物按生物电子等排原理进行结构改造,合成了14个电子等排体,活性亦提高甚小。故认为4 OH化合物是通过Topliss法找到的“最优”化合物,合成即可终止。设计了几十个化合物,第二次建立含有61个化合物的QSAR方程式再次表明:①亲水性越大的基团对活性越有利。5位取代基吸电子性越大,对活性越有利。C3, C5有极强的亲水性基团,NHCO(CHOH)2H(Σπ=-6 ﹒.
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