癫痫孕妇不良妊娠结局的发生概率高于普通孕妇。已有巴比妥类和苯妥英与胎儿先天性心脏病、唇裂、泌尿生殖道畸形有关的报道。一般认为,卡马西平致畸作用较低,丙戊酸钠在治疗幼年型肌阵挛性癫痫以及特发性癫痫大发作时,具有其他药物无法超越的效果。尽管如此,研究同时也发现大多数服丙戊酸钠者仍能分娩正常孩子,提示丙戊酸钠的致畸性存在着药物遗传易感性。还有研究报道,宫内暴露于第一代AEDs的新生儿,出血概率升高。