型酶参与DNA的空间构型变化、复制、重组、转录、切割与再连接和细胞染色质的组织以及有丝分裂等过程。酶Ⅱ a与新复制DNA关系密切,是核基质的成分,在静止期细胞中的活性很低,当细胞由静止转向增殖的过程中活性明显增强。酶Ⅱ b在静止期细胞中亦存在,活性也很低,它与核糖体RNA转录有关。以DNA拓扑异构酶为靶点的药物有:喜树碱类(包括喜树碱,羟基喜树碱,依林特康,拓扑特康,鲁比特康等),VP‐16,VM‐26,阿霉素,玫瑰树碱,新生霉素等,喜树碱类以拓扑酶Ⅰ为靶点,其余药物以拓扑酶Ⅱ为靶点。拓扑酶Ⅱ直接影响DNA的构型,故拓扑酶抑制剂能通过改变DNA的构型而影响基因转录过程。
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