绝大部分口服后可快速完全吸收,1~4小时后达到峰浓度。大部分第二代组胺H1受体拮抗剂有广泛的首过效应,被代谢成活性产物。代谢反应主要由细胞色素P450的CYP3A4介导,CYP3A4有明显的个体差异。第二代组胺H1受体拮抗剂中,阿伐斯汀、西替利嗪、非索那丁几乎不经肝脏代谢。由于药物代谢和组织分布不同,峰浓度也存在差异。抗真菌药、大环内酯类等很多药物和葡萄柚汁会影响肝脏CYP酶功能,导致某些抗组胺药不能被代谢,从而使血浆浓度升高。Pgp在癌细胞、肠壁、血脑屏障、近端肾小管等表达,可影响药物的分布和排泄,可能引起某些重要的药物相互作用。
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