环糊精与客分子形成包合物的过程伴随着吉布斯自由能的改变,这种改变是三种作用的结果:溶剂‐溶剂作用。在水溶液中,包合物形成过程中所伴随的自由能变化可由下式得出:G*comp=-kT lnKmf=ΔGcintrasol+(ΔGC w-ΔGS w-ΔGL w)+ΔgAγ1。除了吉布斯自由能的改变,包合物形成过程中还常伴有一个相对较大的焓变Δ H(负值)和熵变Δ S(或正或负,因单位而异,具体见包合物稳定性部分),目前已对多种药物包合物的热力学参数进行了系统的研究。