耐药菌可产生一些灭活酶破坏大环内酯类的结构而引起耐药。灭活酶导致的耐药与靶位改变引起的耐药不同,只引起结构相关的抗生素耐药。研究发现lnu基因在革兰阳性和革兰阴性菌中的表达有不同特点,尽管LnuA 、 LnuB 、 LnuC和LnuD酶在体外能更有效地灭活克林霉素,但革兰阳性菌相应的基因仅导致林可霉素耐药,并不引起克林霉素耐药,这种现象称为L表型。将这些基因克隆到大肠埃希菌,则细菌可表现出对两种抗生素的交叉耐药,这种现象的详细机制还不清楚,可能与两种抗生素对革兰阳性和革兰阴性菌的核糖体亲和力不同有关。这两种酶从金黄色葡萄球菌和溶血葡萄球菌中发现,可破坏链阳菌素结构而致耐药。
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