Orexin‐A和orexin‐B为33个氨基酸残基和28个氨基酸残基组成。核磁共振显示,orexin‐A有两个二硫键,orexin‐B包含有两个α‐螺旋组成的可折叠环[ 4 ]。Orexin‐A和‐B有46%的同源性,在小鼠、人、大鼠、猪和牛中,orexin‐A的结构完全一致,但和青蛙有5个氨基酸序列的不同。对于orexin‐B,不同种属其氨基酸结构稍有差别,大鼠和小鼠与人的orexin‐B有两个氨基酸的差别,猪只是用脯氨酸取代了丝氨酸位点(见图。在对大鼠的放射性碘的研究中发现orexin‐A和‐B在药物代谢动力学中有较大的不同。选择性的OX2‐R的拮抗剂,4‐苯基‐[ 1,3 ]二氧杂环乙烷,对OX2‐R的亲和力为OX1‐R的600倍[ 8 ]。
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