从理论上讲,任何大小的基因都可以用人工化学合成法来获得。不论是碱基序列已知的基因,还是基因序列未知但肽链氨基酸碱基序列已知的,可以依据密码子简并性原则,从目的肽链的氨基酸序列推导出基因的碱基序列,并且,可以依据宿主细胞(或说生物种类)对密码子使用的偏爱程度,人为选择并确定基因中密码子及其基因碱基序列。但是,如果目的基因比较大,利用人工化学合成法制备目的基因就非常困难和不实用。体现为,化学合成较长基因的费用昂贵。目前,化学合成核苷酸片段的能力在200bp左右,但能够满足实验室要求且序列准确性接近100%的核苷酸长度在150bp左右。
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