将一段DNA序列与已有的基因或基因片段数据比对,是发现基因的另一个主要方法。这些被比对的数据可以分为两大类,一类是核酸序列,主要包括mRNA,cDNA和EST(Expressed Sequence Tag,表达序列标签)。另一类是蛋白质序列数据。有了数据库,进行比对还需要有比对的软件。Blast可以将用户提交的核酸或蛋白质序列与一个数据库中的核酸或蛋白质序列进行比对,并根据相似度依次显示数据库中的序列信息以及比对结果。针对数据库序列和被查询序列的种类,应该使用不同的Blast软件,图20‐5列出了这些主要 ......