一、蛋白质二级结构预测

通过对大量已知空间结构的蛋白质分子的研究和分析，人们发现，尽管一条多肽链可能采取的构象的数目是相当巨大的，但在蛋白质分子中由二级结构组装而形成一定的空间结构的方式却是有限的。蛋白质的二级结构不仅是联系其一级结构和三维空间结构的桥梁和纽带，而且蛋白质的二级结构预测也是解决从蛋白质的一级结构预测其空间结构这一问题的最关键步骤。一般认为，如果二级结构的预测准确率可以达到80%的话，我们就可以基本准确地预测一个蛋白质分子的三维空间结构。SOPMA采取的自优化预测方法建立了已知二级结构序列的次级数据库，库中的每个蛋 ......