转录因子结合位点最简单的表示方法是共性序列。可能与同一个转录因子结合的所有DNA片段按照对应位置进行排列(图11-3),在每个位置上选择最可能出现的碱基,组成了该转录因子结合位点的共性序列。共性序列中用A、C、G、T之外的字母来表示结合位点中各个位置上可能出现的碱基组合(表11-1),这些字母称为IUPAC简并码(IUPAC degenerate codes)。共性序列的表示方法简明易懂,却不能够反映每个位置上不同碱基出现的概率。图11-3转录因子结合位点表示法。 ......