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一、转录因子结合位点的表示方法

转录因子结合位点最简单的表示方法是共性序列。可能与同一个转录因子结合的所有DNA片段按照对应位置进行排列(图11-3),在每个位置上选择最可能出现的碱基,组成了该转录因子结合位点的共性序列。共性序列中用A、C、G、T之外的字母来表示结合位点中各个位置上可能出现的碱基组合(表11-1),这些字母称为IUPAC简并码(IUPAC degenerate codes)。共性序列的表示方法简明易懂,却不能够反映每个位置上不同碱基出现的概率。图11-3转录因子结合位点表示法。 ......

——《生物信息学》
书名:《生物信息学》
栏目:生物信息学 > 第二篇 功能基因组信息学 > 第十一章 转录调控的信息学分析 > 第三节 转录因子结合位点的信息学预测方法
作者:李霞
参编:李亦学,廖飞,田心,刘建国,李霞
页码:299-300
版本:1
出版社:人民卫生出版社
出版时间:2010-08-01
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