病原微生物耐药基因检测可直接通过标本进行,难培养微生物(如结核分枝杆菌)可通过检测基因突变判定是否对抗结核分枝杆菌药物耐药,抗病毒疗效评价更是如此。通过耐药基因检测可准确追踪医院病原体流行病学特征,而且多重PCR可实现病原体检测与耐药性分析同步进行。大多数获得性耐药表型都是由耐药基因介导的,而且细菌的耐药基因除极少例外大多都能表达,耐药基因与耐药表型具有很高的一致性,因此利用核酸技术检测耐药基因是可行的。临床常见的包括:乙肝病毒对拉米夫定的耐药、流感病毒对金刚烷胺耐药、巨细胞病毒对阿昔洛韦耐药、 HIV耐 ......