要鉴定出同一转录因子调控多个靶基因表达的共有结合位点,收集可能被同一转录因子调控的多基因序列是首要步骤。然后通过多种计算方法从不同角度或不同层面去进行计算、评估和分析,尽可能地屏蔽掉冗余序列和噪音序列,寻找出具有统计显著性的短片段,作为转录因子可能的结合位点。图11-4所示为转录结合位点识别的全部流程。高等生物的调控更加复杂,简单的线性模型往往不能很好地反映其中的调控关系,所以又有人提出了基于多变量适应回归模型(multiple adaptive regression splines,MARS)的MARS ......