三、原核生物基因组比较

细菌和真核生物已经相互“交战”几百年了。细菌为了繁殖需要占据人体这个营养丰富的环境。典型的细菌“殖民地”包括皮肤、呼吸道、消化道（口腔、大肠）、尿道和生殖系统等。据估计每个人身上的细菌数目超过自身的细胞数目。大多数情况下，这些细菌对人类是无害的。然而，有些细菌在一定条件下能够导致感染，甚至带来灾难性的后果。最近一些年，由于广泛使用抗生素导致了细菌抗药性的增强，因此亟须找到细菌的毒性因子，然后找到相应的接种疫苗。对这个问题的一个解决办法就是比较细菌的致病株和非致病株。MUMmer的输出结果对于找出两个基因组 ......