三、蛋白质结构域与家族分类

蛋白质的复杂结构和功能依赖于多个结构域的协同。蛋白质缺失某个结构域则其必然缺失对应的生物化学功能。据蛋白质序列相似度或生物化学功能与结构的相似度可将蛋白质分类为家族（family）。同一家族蛋白质有某种类似的生物化学功能或者类似的高级结构。因此，了解蛋白质结构域及家族分类信息，对于蛋白质结构分析有着很重要的意义，并且很多蛋白质家族分类数据库是基于结构分类基础之上构建的。对蛋白质高级结构的比对（alignment）是探索远源蛋白质的有效办法，也是从高级结构预测蛋白质功能、基于结构对蛋白质进行分类等的重要基础 ......