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第三节 新一代测序数据存储、处理与分析

过去,研究人员使用ABI公司的3730XL毛细管电泳测序仪进行基因分析,每年至多能完成六千万碱基的测序量。也就是从那时起,因基因数据过多而产生的问题凸显了出来,而且这个问题随着其他制造商开发出更多更快的测序仪而愈加严重。举个例子,ABI的新一代测序平台SOLiD单次运行,便可以分析6Gb的碱基序列。而Roche / 454测序仪单次运行可以将上述结果转换成12~15个千兆字节(gigabytes)的数据信息。尽管可以为用户提供高达11.25TB的存储量,但对于多数实验室所具有的信息管理系统来说,规模如此庞 ......

——《生物信息学理论与医学实践》
书名:《生物信息学理论与医学实践》
栏目:生物信息学理论与医学实践 > 第六章 新一代测序数据分析 CHAPTER 6 NEXT-GENERATION SEQUENCING DATA ANALYSIS
作者:李霞
参编:张岩,陈秀杰,陈丽娜,王艳秋,刘磊
页码:255-260
版本:1
出版社:人民卫生出版社
出版时间:2013-01-01
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