二次代谢过程来源于一次代谢过程(见图2‐。到目前为止,在二次代谢产物的生物合成中使用最多的基本结构是乙酰辅酶A、莽草酸、甲羟戊酸和1‐去氧木酮糖5‐磷酸酯。糖酶解途径的产物丙酮酸经氧化脱羧可以得到乙酰辅酶A,此外它也可以通过脂肪酸的β氧化来获得,该氧化过程有效的逆转了由乙酰辅酶A合成脂肪酸的途径。在醋酸生物合成途径中产生的重要的二次代谢产物有苯酚、前列腺素和大环内酯类的抗生素,还有各种脂肪酸和在一次、二次代谢界面的衍生物。莽草酸由磷酸烯醇丙酮酸(糖酶解途径的中间体)和赤鲜糖‐4‐磷酸(来自于戊糖磷酸酯途径 ......