第三节 转录因子结合位点的信息学预测方法

大量的实验证据表明，转录因子结合位点的长度一般在6～12bp之间。然而，ChIP-chip技术的分辨率在200～800bp左右，远大于转录因子结合位点的长度，所以需用计算方法来确定转录因子结合位点的确切位置。对转录因子结合位点的计算研究可分为两类问题：第一类问题是通过收集可能被同一转录因子调控的基因启动子序列，在其中寻找具有统计显著性的短片段作为转录因子可能的结合位点，称之为转录因子结合位点的识别（identification of transcription factor binding site）。 ......