卡氏肺孢子菌属先前属于原虫、孢子虫纲,但其超微结构与真菌类似,其16s核糖体RN A以及线粒体DNA序列分析显示其种系发生学上与真菌紧密相关,线粒体DNA核苷酸序列与真菌的同源性( 60%)超过与原虫的同源性(仅20%) ,故目前认为应归属于真菌。 ......