三、分子钟假说

分子钟（molecular clock）假说认为DNA或蛋白质序列的进化速率随时间或进化谱系保持恒定。在20世纪60年代初期，人们就观察到不同物种中蛋白质序列的差异，如血红蛋白、细胞色素C及血纤肽中大致与物种分歧时间成正比。第二，不同蛋白质间或蛋白质的不同区域间进化速率的差异很大，因而分子钟假说允许不同蛋白质间进化速率不同，或者说每个蛋白质有其自身固有的分子钟，以不同的速率跳动。假设拓扑结构A是正确的，而其他的都是不正确的，则表明正确拓扑结构的所有分支长度估计的期望值是0或者正值，而不正确拓扑结构中至少有 ......