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二、基因组范围关联研究软件包SNPtest

SNPtest(http:/ / www . stats . ox . ac . uk /%7Emarchini/software/gwas/snptest html)是一个强大的基因组范围关联研究软件包,它可以对单个SNP关联进行频率检验或贝叶斯检验,值得注意的是,它的实施只适合于二进制(病例对照)性状。目前,被广泛应用的WTCCC中,7套复杂疾病的基因组范围关联研究,就是采用该软件进行的数据分析。SNPtest同时提供了2000个个体中100个SNP的疾病-对照示例文件。贝叶斯检验:在考虑基因型不确定 ......

——《生物信息学理论与医学实践》
书名:《生物信息学理论与医学实践》
栏目:生物信息学理论与医学实践 > 第九章 复杂疾病的系统遗传学分析 CHAPTER 9 SYSTEM GENETICS ANALYSIS OF COMPLEX DISEASES > 第四节 系统遗传学集成软件工具
作者:李霞
参编:张岩,陈秀杰,陈丽娜,王艳秋,刘磊
页码:397-400
版本:1
出版社:人民卫生出版社
出版时间:2013-01-01
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