三、从蛋白质结构推断其功能的方法与分析软件

蛋白质必须有特定的三维空间结构，才能表现其特定的生物功能。蛋白质的进化中保守的三维结构通常对应某些保守的精细生物化学功能，结构相似的蛋白质会有某些相似的精细生化功能。因此单纯依靠蛋白质序列相似性无法预测其功能。基于机器学习的方法在功能预测上有着很大的成绩，如通过数据挖掘和机器学习方法的研究，分析两个数据对象之间的相似性的可变模型来预测功能。但是基于机器学习方法的障碍是缺少可信的蛋白质结构信息，因此随着对蛋白质领域的进一步研究，这种方法会有更好的效果。 ......