第四节 系统遗传学集成软件工具

PLINK（http：/ / pngu . mgh . harvard . edu /～purcell/plink/contact . shtml # cite）是一个免费、开源的全基因组关联分析工具集，旨在用有效地计算方式进行常规的及大规模的遗传分析。PLINK的主要功能包括：数据处理和统计描述、群体分层检测、关联分析、IBD估计及上位效用检测。PLINK一般只适用于群体数据，不适用于家系数据。如果数据集比较小，期望输出所有的检验结果，可以用--epi1参数测定，如：同时也可以通过命令设定进行检验的SN ......