HIV蛋白酶抑制剂是治疗艾滋病的另一类药物。有两种HIV蛋白产物是裂解成熟蛋白的前体,裂解过程受HIV蛋白酶的催化,所释放出的蛋白质对病毒的复制起决定性作用,这些蛋白质包括蛋白酶本身及逆转录酶、整合酶和结构蛋白。其中蛋白酶系门冬氨酸蛋白酶( aspartic proteinase ) ,其特点之一是能水解断裂苯丙氨酸-脯氨酸和酪氨酸-脯氨酸的肽键。而哺乳类动物的蛋白酶难以水解它们。此类药物有沙奎那韦、利托那韦、茚地那韦和奈非那韦。奈非那韦为非肽类蛋白酶抑制剂,通过与HIV蛋白酶的活性位点可逆性键合而起作用 ......