收入费用在开单科室与执行科室间合理分配是成本核算必须加以解决的第一个难题。如果把病房外发生的药费、检查、治疗收费全部归集给执行科室(例如把化验费算给检验科,把放射费算给放射科,药费归集到药剂科)那么绝大多数临床科室均处于亏损状态,这不能被临床医护人员所接受。药费收入是医院收入的重要部分,如果对临床科室进行全成本核算而不将药费的收入计入各科室的收入,那么科室的亏损面肯定会扩大。因此,在计算药费收入时,亦应类似于诊疗、检查收入,将其分为四部分,一部分药品购入成本,一部分药剂科的全成本,一部分留作药剂科的利润, ......