第八节 常用表达谱分析软件

BRB-ArrayTools是基因芯片数据分析的集成软件包。BRB-ArrayTool能够处理不同芯片平台，单、双通道的表达谱数据，该软件基本功能有数据可视化、标准化处理、差异基因筛选、聚类分析、分类预测、生存期分析、基因富集性分析等。ArrayTools以Excel插件的形式呈现，用户界面友好，计算由Excel外部的分析工具完成。高水平分析包括基因过滤、样本比较、层次聚类、分类分析、通路分析、LOH和SNP芯片的拷贝数分析等全面的数据分析。Limma是使用线性模型进行实验分析和差异表达分析（如倍数差异、 ......